Добрый день!
Я в этом году возвращала суммы пошлины из службы кадастра и регистрации. Я написала им заявление на возврат, приложила копию платежного поручения и они все вернули. Бланк заявления во вложении. Правда в вашем случае затрудняется тем, что они не видят оплату. Вам можно обратиться в тот банк, где вы оплачивали пошлину и попросить их подтвердить оплату.
Вот что написано по вопросу возврата платы на сайте Росреестра
Цитата:Возврат платежа осуществляется на основании заявления заявителя или его правопреемника либо на основании решения суда.Заявление о возврате платежа представляется в орган, осуществляющий государственную регистрацию прав, в который подавался запрос о предоставлении государственной услуги в виде бумажного документа при личном обращении или путем почтового отправления.В заявлении о возврате платежа указываются банковские реквизиты, необходимые для возврата платежа лицу, подавшему такое заявление (фамилия, имя, отчество (при его наличии) или наименование юридического лица, ИНН (при его наличии), КПП (при его наличии), лицевой или банковский счет, наименование банка получателя, БИК, корреспондентский счет банка), а также почтовый адрес или адрес электронной почты.К заявлению о возврате платежа прикладывается оригинал или копия документа, подтверждающего оплату государственной услуги. Указанная копия документа заверяется расчетной организацией, осуществившей данный платеж. Заверение копии документа, подтверждающего перечисление платежа, не требуется в случае, если при представлении заявления о возврате платежа при личном обращении предъявляется оригинал документа, подтверждающего перечисление платежа, который возвращается заявителю.В случае подачи заявления о возврате платежа правопреемником заявителя к такому заявлению прикладываются документы, подтверждающие переход прав требования к правопреемнику заявителя, в том числе заверенные в установленном порядке выписки из передаточных актов, разделительных балансов, единого государственного реестра юридических лиц.Заявление о возврате платежа и прилагаемые к нему документы принимаются специалистом, ответственным за прием запросов о предоставлении государственной услуги.Орган, осуществляющий государственную регистрацию прав, получивший заявление о возврате платежа и являющийся администратором доходов бюджета, в течение 10 (десяти) рабочих дней со дня поступления указанных в пункте 2 документов принимает решение о возврате излишне уплаченных денежных средств.При отсутствии в заявлении о возврате платежа сведений или непредставлении документов, установленных пунктом 2, такое заявление считается неполученным и не рассматривается.Решение об отказе в возврате излишне уплаченных денежных средств направляется лицу, подавшему заявление о возврате платежа, в течение 2 (двух) рабочих дней со дня подписания руководителем органа, осуществляющего государственную регистрацию прав, посредством почтового отправления.